Várias razões, na verdade.
1) O melhor serviço de inteligência / o melhor espião é aquele que ninguém sabe que existe ou trabalha na área. O espião que você conhece com certeza é um espião do país estrangeiro que informa sobre desenvolvimentos interessantes é chamado "parte da equipe da embaixada" ou talvez "embaixador" e o local em que esses tipos se reúnem é chamado "embaixada". O Starfleet Intelligence é um serviço de inteligência conhecido cujos agentes você pode identificar. Como você identifica alguém como um agente da força oposta, se você não sabe que a força oposta existe?
2) A Federação tem demonstrado consistentemente ser uma federação de idealistas otimistas, diplomáticos, altruístas e democráticos. De fato, faz muito sentido que "o povo" da Federação queira que seu governo eleito democraticamente tenha uma supervisão muito próxima do que é chamado de "instrumentos de força", militar, inteligência e aplicação da lei. Militar, neste caso, significa Frota Estelar, serviços de inteligência são Frota Estelar e a aplicação da lei é deixada para a polícia local de todos os membros, com a Frota Estelar ocasionalmente ajudando os habitantes locais, se o mal-entendido tiver naves espaciais ou tiver fugido do mundo (consulte Segurança da Milícia Bajoran / Odo pessoal por exemplo). O pessoal da Frota Estelar e o conselho dirigente da Federação têm demonstrado consistentemente ser incapazes de comprometer seus ideais, mesmo em situações terríveis (o incidente TNG "Picard e Borg drone Hugh" pode ser tomado como um exemplo inicial, toda a série "Voyager" começou por causa de mas há muitos outros exemplos disso, tanto nos Termos de Serviço quanto depois).
A crueldade durante as operações de inteligência e o idealismo utópico em que "toda espécie é amiga em potencial e não matamos pessoas sem procedimentos legais adequados, a menos que em legítima defesa". não misture bem. Portanto, os serviços de inteligência sofrerão eficácia. Se um agente matar espião inimigo durante uma missão, você pode ter certeza de que precisará haver um relatório justificando isso. Se um agente destruir dados ou cometer sabotagem, informe. Se um agente cometer vários assassinatos para o bem da Federação, relate e relate uma dúzia de outros relatórios para garantir que eles sejam absolutamente necessários e que realmente seja para o bem maior. E isso é pedir perdão após o fato. Pedindo permissão para fazer isso ... sim, você não receberá essa permissão. Assim, a Seção 31.
Um grupo de fanáticos fundamentalistas do tipo Cavaleiro Templário, dispostos a sujar as mãos e ensangüentar para garantir a segurança da Federação. E, embora cada um saiba que pessoalmente não vive de acordo com os ideais "possivelmente bons demais para ser verdade" da Federação, eles têm certeza de que fazem o que precisa ser feito, para que esses ideais possam ter uma chance neste universo cruel e frio. . Tudo o que precisa ser feito. Nenhuma ação é muito baixa, nenhum preço é muito alto, para a segurança e a existência contínua da Federação. Mesmo genocídio das espécies, para remover a ameaça futura. E assim a Federação não é hipócrita. Porque eles realmente não sabem que isso está acontecendo. E sempre podemos dizer: "Oh, esses eram apenas alguns fanáticos equivocados. Desculpe por isso. Eles pensaram que gostaríamos disso. Obviamente, não gostamos disso. Nós nem sabíamos que eles existiam. Eles estavam fazendo coisas ruins em nosso nome. ... Meu Deus, NÃO! Absolutamente não! "
E reagir da mesma maneira que o governo dos EUA reagiria às ações de um grupo terrorista inspirado na constituição dos EUA. (Emenda 21st para ser mais preciso. A que revoga o 18, proibição de produção e venda de álcool)
Então, por que o Starfleet Intelligence não faz isso, apenas remove a supervisão? Porque eles fazem parte da Frota Estelar e da Federação e isso iria contra os ideais da Federação e seria considerado uma garra de poder. E a Federação está acima de coisas como poder e dinheiro, ganância e todas aquelas partes básicas ruins da natureza humana. Direito?