Pode ser transformado em um plano funcional (se perturbador)
Observe que, como Mestre, você é capaz de simplesmente dar ao BBEG algum artefato aleatório ou ritual de sangue que permita que esse plano aconteça. A sugestão a seguir simplesmente tenta ajustá-lo mais à mecânica do jogo e aos feitiços / fluff oficiais.
Primeiramente, sobre a suposição de dragões eclosão com um CR de 0. Simplesmente não é esse o caso. Embora não exista um livro atual sobre fisiologia do dragão e ciclos de envelhecimento, essas informações não mudaram muito desde que foram lançadas nas edições anteriores. Vou citar um pouco das mais recentes [4e's] Draconomicon sobre dragões cromáticos, página 13:
Hatching:
When a wyrmling is ready to hatch [...] [it] breaks free by clawing at the sides, pressing against and cracking the shell with brute strength, and blasting the shell occasonally with its own already developed breath weapon.
[...]
A newly hatched dragon has a full array of ablities. Although inferior to those of a young dragon these ablilties are sufficient for the wyrmling to take care of itself, at least against relatively weak threats and predators. Although an emerging wyrmling's sodden and somewhat awkward, it can run within hours of haching and can fly within a day or two. A wyrmling's senses are acute and [...] it is born with a substantial amount of its parent's knowledge imprinted in its mind [...] [and] the generalities of the world and its own identity.
No segundo em que estão fora de sua concha (ou nesse mesmo estado da polimorfia), a serpente é uma ameaça para qualquer camponês comum. Pode sofrer de falta de coordenação, mas um ataque de respiração ainda é um ataque de respiração. Como @Rubiksmoose e outros disseram em suas respostas, as crianças em suas formas "puras e naturais" não farão muito bem como forragem de polimorfo, a menos que você prepare sua ingredientes um pouco, é claro.
Uma abordagem para transformar crianças em criaturas poderosas o suficiente para serem transformadas em serpentes de dragão seria uni-las com demônios, de preferência Succubi / Incubi. Dessa forma, você pode criar um exército de pequenos feitiços encantados (encantados a longo prazo de acordo com o cotão 5e, não apenas o feitiço), fazendo seus lances e ficando mais corrompidos / poderosos até um nível em que possam se tornar mais dignos de seu BBEG por de boa vontade se transformando em um dragão bebê e ainda mais de boa vontade abraçar o olhar horripilante de seus fantasmas para crescer grande e forte (assumindo que o amadurecimento anda de mãos dadas com o envelhecimento). Um dragão obediente, com lavagem cerebral, parece muito mais útil do que uma máquina assassina frenética que literalmente destruirá tudo o que está ao seu redor.
Alguns profissionais dessa abordagem:
- Poucas ou nenhuma perda no departamento de fantasmas e lacaios (cada um de seus fantasmas pode ser "morto" em pelo menos ataques do tipo 3 no estágio de destruição, ainda mais rápido em idades posteriores)
- Aqueles dragões podem ser usados com muito mais precisão (se o seu BBEG rola dessa maneira. Caso contrário, eles ainda podem dar errado quando quiserem, é claro)
- Os succubi / incubi necessários para doutrinação e pacto pacífico podem visitar aldeias à noite e convencer as crianças a correr para as florestas para facilitar a coleta
- Enquanto você espera o pacto deles com os demônios para crescer forte o suficiente, você tem um pequeno exército de magias do inferno à sua disposição
Alguns contras:
- Você precisa de succubi / incubi obedientes
- A doutrinação leva um tempo (pode exigir um certo tipo de personalidade)
- Empoderar leva outro tempo
- Os dragões podem ser persuadidos a trair se mantiverem (a maioria) de sua sanidade
O maior (potencial) con:
Na minha experiência geral de interpretação de personagem (anos 14 de forma livre rp, anos 6-ish de experiência de mesa), a maioria das pessoas tem uma intolerância especial em ver crianças sendo prejudicadas, e muito menos prejudicá-las ativamente. Fazer com que seu jogador lute com alguma criatura cruel apenas para descobrir que, na verdade, uma criança pequena e indefesa e torturada poderia potencialmente cicatriz jogadores sensíveis. Antes de embarcar em um enredo tão perturbador, é melhor você ter certeza de que eles estão bem com ele ou, pelo menos, podem aceitá-lo (seja através de uma pesquisa sobre o que fazer e o que não deve ser feito antes do jogo ou em qualquer outro lugar antes que algo de grande enredo possa acontecer, perguntando indiretamente para eles o que pode ser "demais" para eles em sua campanha ou simplesmente perguntando a eles). Ter uma campanha em abundância de piadas de sorte e de repente virar um beco tão sombrio pode incomodar os jogadores de uma maneira ou de outra. Essas coisas podem acabar quebrando jogos e o amor de algumas pessoas pelo jogo.
Uma última questão (honestamente pequena):
Dependendo de como você a interpreta, uma criatura polimórfica permanentemente verdadeira não voltar ao que costumava ser originalmente, permanece o mesmo do que havia sido apenas alguns segundos antes de ser morto. É um ponto minúsculo que você pode facilmente decidir para funcionar como quiser, mas alguns jogadores do direito podem tentar lutar com você nesse sentido.
TL, DR
Com algumas etapas ajustadas, é facilmente alcançável. Seus jogadores podem não estar muito felizes com o que você os fez fazer.