Sim, mas isso realmente não importa.
O erro que parece ser uma suposição subjacente na sua pergunta é que você está tratando o altímetro de pressão como medida de altitude. Não faz.
Em vez disso, mede a diferença entre a pressão estática e a pressão de referência (a última é a "configuração do altímetro").
Essa diferença é expressa como uma altitude, mas é realmente uma diferença de pressão. Poderia muito bem ser expresso como apenas ρref−ρestático, cujo valor também aumentaria à medida que a aeronave subir, mas seria menos intuitivo (e provavelmente menos preciso, se não necessariamente menor) preciso) especialmente quando perto do chão.
(Isso não é muito diferente de como um indicador de velocidade no ar realmente não diz a você velocidade, diz a você a diferença entre pressão estática e dinâmica, mas a escala é tal que essa diferença de pressão é expressa como uma velocidade. Isso é por que o ASI age quando o tubo pitot está bloqueado.)
Para aeronavegabilidade, é necessário um altímetro para exibir o valor correto dentro de alguma margem de erro da qual não sei o valor exato. A separação vertical é então escolhida de modo que a diferença mínima na altitude real, dada a mesma configuração do altímetro, entre duas aeronaves seja suficiente para garantir uma folga vertical entre elas, mesmo que ambas apresentem erros de instrumento que sejam extremamente infelizes.
As altitudes mínimas de segurança do IMC também são selecionadas de maneira semelhante, para garantir a eliminação de obstáculos, mesmo que o altímetro esteja no máximo fora da calibração.
Como todas as aeronaves dentro de uma área devem estar no mesmo altímetro ou (acima da altitude de transição) no padrão de 1013.25 hPa, desde que todos ajustem seu altímetro corretamente, os erros serão todos muito semelhantes e todos , digamos, "5000 ft" ou "FL310" está voando muito próximo ao mesmo nível de pressão estática, mesmo que esse nível não corresponda exatamente para 5000 ft AMSL ou 31000 ft AMSL. Assim, enquanto você estiver correto na teoria, não é um problema na prática.