Se você chegar em um voo doméstico, não precisará passar pela alfândega ou imigração. Sua bagagem também deve ser despachada já (se os dois segmentos estiverem reservados em um bilhete, obviamente). O que poderia ser um problema, se o seu voo internacional partir de um terminal diferente (por exemplo, se sair do terminal 5 e o seu voo doméstico chegar no 1). Mais uma vez, se tudo estiver reservado em um bilhete, a companhia aérea é responsável por remarcar você para o próximo voo possível, se você perder o voo original).
Se você reservou dois bilhetes separados, acho que já é uma garantia de perder seu voo internacional.