Sim.
Seu corpo está em um estado catatônico, mas não está morto de acordo com o feitiço Magic Jar. Observe o texto:
The only action you can take is to project your soul up to 100 feet out of the container, either returning to your living body (and ending the spell) or attempting to possess a humanoid's body.
Isso implica que seu corpo ainda está vivo depois de lançar o Magic Jar. Enquanto estiver vivo, conta como uma criatura e, portanto, é um alvo válido para o feitiço Aprisionamento.
Observe que as regras não fornecem uma definição precisa de criatura, mas seria muito estranho se um corpo vivo não fosse uma criatura. Entre outras coisas, seria imune a veneno.