In Homem de Ferro Na edição 218, vemos que ele criou um traje, o Modelo de Armadura do Homem de Ferro Modelo 6 ou Hydro Armor, especificamente para entrar na água.
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In Vingadores Vol 8 Na edição 9, vemos o Modelo de Armadura do Homem de Ferro 61, que ele usa especificamente para lutar debaixo d'água.

No Manual de Ferro nós vemos o seu traje de submersão profunda.

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No MCU, as armaduras de Tony parecem lidar razoavelmente bem debaixo d'água. No Os Vingadores nós o vemos no mar embaixo d'água consertando o oleoduto.
In Iron Man 3 vemos a armadura Hammerhead como parte do Protocolo do Partido na Casa.

Como a região está bloqueada, não consigo baixar o aplicativo, mas o Homem de Ferro 3 - JARVIS: Uma Experiência na Segunda Tela app pelo visto descreve esta armadura como:
Deep Sea Diving Suit designed for extreme pressure and traveling at high-speeds underwater. Features upgraded work-lights for high visibility.