Com base no que sabemos sobre Flamel (adora ópera, tem uma residência em Devon em algum momento), certamente é possível que esta casa no centro de Paris seja uma pied-à-terre, uma pequena casa que ele e sua esposa mantêm com a finalidade de visitar a cidade e onde Flamel pode conduzir seus experimentos alquímicos sem incomodar seus vizinhos.

FLAMEL: I’m afraid we keep no food in the house.

_{^{The Crimes of Grindelwald - Original Screenplay}}

Sendo esse o caso, presumivelmente sua esposa ainda está em Devon. Dumbledore disse para ele dar uma passada para preparar o local para receber visitantes em uma emergência, daí a sua chegada.

Em uma nota lateral, você pode notar que ela parece estar totalmente ausente de toda a gama de livros de fatos vinculados, ou pelo menos aqueles que foram digitalizados pelo Google Livros.

Flamel diz 'não mantemos comida', o 'nós' possivelmente se refere à sua esposa.

A esposa desses Flamel nunca é mostrada ou mencionada em Fantastic Beasts: The Crimes of Grindelwald, em um momento Flamel diz a Jacob que 'não mantemos comida em casa', o que implica que há mais de uma pessoa morando na casa; caso contrário, faria mais sentido para ele usar o pronome 'eu'.

A figure appears behind JACOB. Six-hundred-year-old NICOLAS FLAMEL stands at the entrance to his alchemist’s studio.

FLAMEL
I’m afraid we keep no food in the house.
_{^{- Fantastic Beasts: The Crimes of Grindelwald (The Original Screenplay)}}

É possível que isso signifique que sua esposa mora lá, mas simplesmente não é vista por algum motivo.