Devo entrar no espaço Schengen usando os portões E?

Eu acredito que é desencorajado evitá-los se você for elegível, mas não há nada no Código das Fronteiras Schengen que menciona o controle automatizado de passaportes de uma maneira ou de outra. A prática pode variar de um país para outro, uma vez que os portões eletrônicos são implementados por cada país e não por uma autoridade central.

No verão passado, eu estava saindo do espaço Schengen via Amsterdam Schiphol com alguém que tinha um passaporte não biométrico da UE. Fomos para a mesa, mas nos aproximamos separadamente. Quando o oficial me devolveu meu passaporte, ele perguntou se eu estava viajando sozinho. Eu disse "não" e esse foi o fim. Eu suspeito que, se eu tivesse dito "sim", ele teria sugerido que eu usasse os portões da próxima vez. Mas desde que isso aconteceu depois de ele me processou, ele obviamente não me mandaria para os portões porque me faltava um motivo adequado para não usá-los.

Para ecoar a resposta de Mark Mayo, aqui está uma citação de Site de Schiphol, com ênfase adicionada:

Cross the border faster with eGate

eGate is an automatic self-service border checkpoint. You cross the border faster than with a manual inspection because you scan your own passport. You can use the automatic gates if you are 16 or over and hold an EU passport that contains a microchip. Follow the instructions at the gate for a smooth passage. Watch the video below to see how the system works.

Da mesma forma, de a polícia federal alemã (Encontrei este link em uma página de Aeroporto de Frankfurt):

What is EasyPASS?

...

This free of charge and voluntary service is an important component of integrated border management in Europe. The EU supports the new control system with funds from the European External Borders Fund.