O negócio todo estava fora dos registros (por exemplo, Saul tenta descobrir algo de seu cara no escritório (um confidente do presidente?), ou como Dar Adal diz a Saul). O principal ponto do acordo foi que há apenas uma cópia e esta cópia pertence a Saul / Dar Adal (Além disso, não se esqueça que Haqqani prometeu não atacar quaisquer instalações dos EUA (mais;)).
Dito isto, a CIA (ou qualquer outra pessoa) não sabe do negócio e nunca saberá. (Para responder à sua pergunta, o acordo foi aceito, uma vez que eles não sabiam disso. Foi Dar Adal por conta própria quem fez isso para deixar alguém saber (espere por Saul e Carrie no final)).
Na minha opinião, a motivação para tal acordo foi dupla:
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As pessoas (tanto os líderes políticos como as pessoas de alto nível dentro da CIA como Dar Adal) querem se livrar de Lockhart como chefe da CIA (ele está sendo culpado pelo ataque à embaixada).
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Eles também querem ter alguém no comando e garantir que ele permaneça lá por mais tempo e não tenha dívidas pendentes. Não se esqueça que a CIA parece estar fraca após o ataque de 12/12 no final da 2ª temporada e o incidente na embaixada.
O vídeo seria uma dívida tão grande e poderia levar a problemas no futuro se Saul se tornasse novamente diretor da CIA.