Eu sempre assumi que quando você foi colocado no computador pela primeira vez, foi criado um 'Personagem' que você estaria controlando. Para ser suficientemente detalhado (com história, hábitos, etc.), foi projetado para estar em sintonia com um humano real; Os personagens 'jogáveis' teriam que ser construídos um pouco 'organicamente', embora muito rapidamente, já que eram totalmente virtuais, mas, na verdade, 'crescidos', de modo a terminar com um nível realista de complexidade.
Quando um personagem entrou na simulação, você viu uma tela falando sobre "Transferência de consciência" e uma voz anunciando "Download concluído". Assumindo, por uma questão de argumentação, que o 'ser / alma / o que quer que seja' era muito complicado para ser lido e armazenado, a mente não era tão copiada quanto movida (muito parecido com o modo como os Transportadores de Jornada nas Estrelas não podem > [1] copie uma pessoa, basta movê-la.
Nesse caso, o natural era sustentar as funções cerebrais necessárias, enquanto a mente 'Real' se foi, seria copiar a mente simulada, com a consciência inibida.
Eu não tenho absolutamente nenhum apoio canônico para isso; é exatamente o que eu assumi e parece se encaixar no que acontece.
[1] normalmente não pode; Eu sei que existem exceções